Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Cds1P98191 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cds1P98191 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cds1P98191 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cds1P98191 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms