Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcc1P97496 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcc1P97496 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcc1P97496 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms