Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LystP97412 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LystP97412 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LystP97412 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LystP97412 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LystP97412 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LystP97412 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LystP97412 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LystP97412 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LystP97412 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LystP97412 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LystP97412 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LystP97412 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LystP97412 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LystP97412 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LystP97412 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LystP97412 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LystP97412 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LystP97412 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LystP97412 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LystP97412 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LystP97412 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LystP97412 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LystP97412 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LystP97412 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LystP97412 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LystP97412 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LystP97412 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LystP97412 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LystP97412 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LystP97412 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LystP97412 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LystP97412 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LystP97412 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LystP97412 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LystP97412 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LystP97412 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LystP97412 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LystP97412 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LystP97412 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LystP97412 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LystP97412 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LystP97412 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LystP97412 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LystP97412 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LystP97412 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LystP97412 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LystP97412 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LystP97412 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LystP97412 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LystP97412 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LystP97412 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LystP97412 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LystP97412 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LystP97412 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms