Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptlc2P97363 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc2P97363 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms