Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhodP97348 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhodP97348 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhodP97348 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhodP97348 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhodP97348 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhodP97348 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhodP97348 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhodP97348 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RhodP97348 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RhodP97348 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RhodP97348 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhodP97348 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhodP97348 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhodP97348 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhodP97348 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhodP97348 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhodP97348 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhodP97348 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhodP97348 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RhodP97348 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RhodP97348 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms