Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrp1P97333 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Nrp1P97333 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrp1P97333 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrp1P97333 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrp1P97333 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrp1P97333 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrp1P97333 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms