Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Mesp1P97309 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms