Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp2P97299 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp2P97299 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms