Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vgll3P85442 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vgll3P85442 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms