Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx1P83917 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx1P83917 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms