Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cct7P80313 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cct7P80313 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cct7P80313 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cct7P80313 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cct7P80313 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms