Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8a1P70704 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8a1P70704 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp8a1P70704 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms