Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf3P70671 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf3P70671 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf3P70671 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf3P70671 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Irf3P70671 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf3P70671 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf3P70671 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf3P70671 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms