Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp9xP70398 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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