Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad50P70388 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad50P70388 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad50P70388 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad50P70388 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad50P70388 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rad50P70388 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad50P70388 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms