Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufd1P70362 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufd1P70362 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufd1P70362 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms