Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp4P70343 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp4P70343 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp4P70343 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp4P70343 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Casp4P70343 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp4P70343 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casp4P70343 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms