Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad1P70340 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad1P70340 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad1P70340 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad1P70340 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms