Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tbx6P70327 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tbx6P70327 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms