Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aup1P70295 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aup1P70295 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aup1P70295 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aup1P70295 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Aup1P70295 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms