Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Stra8P70278 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stra8P70278 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stra8P70278 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stra8P70278 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stra8P70278 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stra8P70278 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stra8P70278 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Stra8P70278 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stra8P70278 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stra8P70278 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Stra8P70278 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stra8P70278 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Stra8P70278 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stra8P70278 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stra8P70278 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms