Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb4bP68372 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4bP68372 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4bP68372 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms