Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg1P63260 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg1P63260 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg1P63260 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg1P63260 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg1P63260 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms