Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgb1P63158 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgb1P63158 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgb1P63158 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms