Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp2P63044 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp2P63044 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms