Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbx1P62878 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbx1P62878 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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