Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmc1P62192 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmc1P62192 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms