Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrch1P62046 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms