Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ufm1P61961 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ufm1P61961 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms