Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga11P61622 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga11P61622 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga11P61622 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga11P61622 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms