Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2fP61219 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms