Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2kP61087 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms