Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CirbpP60824 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CirbpP60824 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CirbpP60824 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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