Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rims4P60191 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rims4P60191 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms