Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b6P59708 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms