Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3bP59470 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3bP59470 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr3bP59470 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms