Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp4P59240 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp4P59240 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp4P59240 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms