Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup43P59235 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup43P59235 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms