Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarf2P59222 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarf2P59222 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms