Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcif1P59114 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcif1P59114 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms