Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fermt1P59113 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fermt1P59113 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fermt1P59113 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fermt1P59113 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fermt1P59113 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Fermt1P59113 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fermt1P59113 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fermt1P59113 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fermt1P59113 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fermt1P59113 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fermt1P59113 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fermt1P59113 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fermt1P59113 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fermt1P59113 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fermt1P59113 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fermt1P59113 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fermt1P59113 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms