Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csrnp3P59055 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Csrnp3P59055 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Csrnp3P59055 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms