Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd4P58467 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd4P58467 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd4P58467 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd4P58467 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd4P58467 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd4P58467 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms