Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uchl4P58321 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uchl4P58321 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl4P58321 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl4P58321 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl4P58321 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl4P58321 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl4P58321 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl4P58321 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl4P58321 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl4P58321 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uchl4P58321 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl4P58321 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl4P58321 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl4P58321 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl4P58321 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl4P58321 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Uchl4P58321 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms