Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NcstnP57716 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NcstnP57716 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NcstnP57716 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NcstnP57716 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NcstnP57716 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms