Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn18P56857 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn18P56857 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms