Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bace1P56818 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bace1P56818 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bace1P56818 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms