Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lim2P56563 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lim2P56563 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lim2P56563 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lim2P56563 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lim2P56563 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lim2P56563 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lim2P56563 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lim2P56563 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms