Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctbp2P56546 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms