Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms